Expression and clinical significance of DCAF8 gene in multiple myeloma
DOI:10.3872/j.issn.1007-385x.2021.10.006
- VernacularTitle:基因DCAF8 在多发性骨髓瘤中的临床意义
- Author:
SUN Hao
1
;
WANG Kefei
1
;
FANG Teng
1
;
HAO Mu
1
Author Information
1. Institute of Hematology and Blood Diseases Hospital, Chinese Academy of Medical Sciences and Peking Union Medical College, State Key Laboratory of Experimental Hematology, National Clinical Research Center for Blood Diseases, Tianjin 300020, China
- Publication Type:Journal Article
- Keywords:
多发性骨髓瘤;蛋白酶体通路相关基因8;泛素-蛋白酶体通路;XPO1 蛋白
- From:
Chinese Journal of Cancer Biotherapy
2021;28(10):990-997
- CountryChina
- Language:Chinese
-
Abstract:
[摘要] 目的:寻找多发性骨髓瘤(MM)基因芯片数据集中的潜在致病基因、疾病诊断和预后相关因子并阐明其作用机制。
方法:获取基因芯片数据集GSE13591 和Zhan Myeloma,使用R 语言进行基因差异表达分析。对共同高表达基因进行Meta 分
析,得到P 值中位秩次TOP10 基因。CCLE 数据库分析TOP10 基因在各肿瘤细胞系中的mRNA表达情况,筛选出蛋白酶体通路
相关基因8(DCAF8)。cBioPortal 数据库中分析DCAF8 基因在各肿瘤细胞系的突变率。WB检测DCAF8 蛋白在骨髓瘤细胞系中
的表达情况。SPSS 和Graph Pad 软件分析DCAF8 表达量和MM患者临床特征之间的相关性,进行受试者工作特征曲线(ROC曲
线)绘制和生存分析。R语言Custer Profiler Package 和Metascape 数据库对DCAF8 互作蛋白基因和共表达基因进行GO和KEGG
功能富集分析。结果:数据集GSE13591 和Zhan Myeloma 的上调基因取交集得到477 个共同高表达基因。在合并数据集中对上
述基因进行Meta 分析,得到P 值中位秩次TOP10 基因,DCAF8 在MM细胞系中的平均表达水平最高。DCAF8 基因在浆细胞骨
髓瘤中的突变率位于各肿瘤细胞系的第一位。DCAF8 蛋白在多种MM细胞系中的表达量显著升高(P<0.01)。DCAF8 表达量与
MM患者的肿瘤负荷显著正相关,1q21 扩增阳性组的DCAF8 的表达量显著高于1q21 阴性组。ROC曲线显示DCAF8 的表达水平
可以很好地区分MM患者和正常人(P<0.01)。DCAF8 高表达组比DCAF8 低表达组中位生存时间显著缩短。蛋白互作网络显示
DCAF8 可与XPO1 蛋白直接相互作用。GO和KEGG功能富集分析结果表明,DCAF8 与蛋白酶体功能、剪切体活性、组蛋白乙酰
化酶活性、RNA转运等功能相关。结论:DCAF8 在MM中显著高表达,其表达水平可以很好地区分MM患者和正常人;其高表
达与MM患者的生存预后显著负相关,且与1q21 扩增和XPO1 蛋白相关。
- Full text:20211006.pdf