Expression of PKMYT1 in glioma and its association with prognosis, drug sensitivity, and immune infiltration
DOI：10.3872/j.issn.1007-385x.2025.05.007
- VernacularTitle:PKMYT1在胶质瘤中的表达及其与预后、药物敏感性和免疫浸润关联性的分析
- Author:
XIE Huiping1
1
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2
,
3
;
LIU Jiajun2
1
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2
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3
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CHEN Jiabin2
1
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2
,
3
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ZHU Lihua1
1
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2
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3
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ZHANG Zhifei2
1
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2
,
3
;
YANG Zhaoyong3
1
,
2
,
3
Author Information
1. School of Basic Medical Sciences, North China University of Science and Technology, Hebei Key Laboratory for Chronic Diseases, Tangshan 063000, Hebei, China;
2. School of Pharmacy, North China University of Science and Technology, Tangshan 063000, Hebei, China;
3. Institute of Pharmaceutical Biotechnology, Chinese Academy of Medical Sciences, Peking Union Medical College, China, Beijing 100050, China
- Publication Type:Journal Article
- Keywords:
胶质瘤；膜相关酪氨酸/苏氨酸蛋白激酶1；细胞周期；预后；免疫浸润；药物敏感性
- From:
Chinese Journal of Cancer Biotherapy
2025;32(5):498-509
- CountryChina
- Language:Chinese
-
Abstract:
[摘 要] 目的：通过生物信息学分析膜相关酪氨酸/苏氨酸蛋白激酶1（PKMYT1）在胶质瘤中的表达与预后价值、生物学功能、药物敏感性、基因突变及免疫浸润的关联性。方法：基于中国胶质瘤基因组图谱数据库（CGGA）和癌症基因组图谱数据库（TCGA）分析PKMYT1的差异表达情况。通过基因本体论分析（GO）和基因集富集分析（GSEA）预测PKMYT1可能富集的通路。将PKMYT1与细胞周期相关基因和基因集进行Pearson相关性和基因集变异分析（GSVA）。进一步对PKMYT1高低表达组在胶质瘤患者进行生存预后、基因突变、药物敏感性及免疫浸润分析。结果：PKMYT1在WHO高级别胶质瘤（P < 0.000 1）、异柠檬酸脱氢酶（IDH）野生型胶质瘤（P < 0.05）和胶质母细胞瘤（P < 0.000 1）中显著高表达。PKMYT1低表达组患者的OS率显著高于高表达组（P < 0.05）。Cox回归分析结果显示PKMYT1表达水平是OS的独立预后因素（P < 0.05）。GO和GSEA分析结果表明，与PKMYT1共表达的基因集主要富集在细胞周期、DNA复制和DNA损伤修复等信号通路上。Pearson相关性和GSVA分析结果显示，PKMYT1的表达与细胞周期相关基因、基因集及细胞周期检查点基因呈显著正相关（P < 0.01）。药物敏感性分析发现，PKMYT1高表达组患者对奥希替尼、达拉非尼、卡莫司汀和西地尼布具有较高敏感性（P < 0.05）。突变分析发现IDH1基因在PKMYT1低表达组中具有更高的突变频率。免疫浸润分析结果表明，PKMYT1的表达与胶质瘤基质评分（r = 0.13，P < 0.001）、免疫评分（r = 0.11，P < 0.01）和ESTIMATE评分（r = 0.13，P < 0.001）显著正相关；且与调节性T细胞（Treg细胞）和M2型巨噬细胞的免疫细胞浸润水平显著正相关（P < 0.05）。结论：PKMYT1高表达的患者预后较差，其机制可能与肿瘤免疫浸润和细胞周期调控有关。PKMYT1有望成为胶质瘤诊断和治疗的潜在靶点。
- Full text:202506160959567433520250507.pdf
