Classification of GINS family members based on their expression levels in glioma tissues and its clinical significance

LIAO Yongzhen1; LIANG Lu2; LI Yi2; CONG Li2

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Classification of GINS family members based on their expression levels in glioma tissues and its clinical significance

VernacularTitle:基于GINS家族成员在胶质瘤组织中的表达水平对其进行分型及其临床意义
Author: LIAO Yongzhen1 ^{1
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2} ; LIANG Lu2 ^{1
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2} ; LI Yi2 ^{1
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2} ; CONG Li2 ^{1
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2}
Author Information

1. Department of Clinical and Pharmaceutical, School of Medicine & Health Care, Shunde Polytechnic, Foshan 528300, Guangdong, China;
2. Department of Basic Medicine, School of Medicine, Hunan Normal University, Changsha, 410013 Hunan, China
Publication Type:Journal Article
Keywords: 胶质瘤；GINS家族；分子分型；预后；分子对接；中药
From: Chinese Journal of Cancer Biotherapy 2024;31(3):261-270
CountryChina
Language:Chinese
Abstract: [摘要] 目的：基于GINS家族成员在胶质瘤组织中表达水平对其分型，探究此分型预测胶质瘤患者的预后、免疫治疗疗效的有效性，采用TCMOI数据库虚拟筛选可靶向GINS的中药小分子。方法：数据库分析GINS基因组学、胶质瘤组织中差异表达基因与患者预后的关系，基于GINS家族成员基因表达对胶质瘤进行分型并分析各亚型的预后情况，数据库数据分析各亚型中的基因突变、基因富集、肿瘤纯度和免疫细胞浸润评分，以及与GINS2可能相互作用的中药小分子，最后用qPCR法检测中国人胶质瘤组织中GINS1~4 mRNA的表达水平以验证其与数据库数据的一致性。结果：GINS家族各成员间的基因、蛋白结构和功能相似，胶质瘤组织中GINS家族成员呈高表达且与患者不良预后密切相关（P<0.05），基于GINS家族成员在胶质瘤组织中表达水平的S1、S2亚型分类能较好地预测胶质瘤患者的预后，S1亚型主要突变基因为CDKN2A/B、EGFR、PTEN而S2亚型的突变基因为IDH1、TP53和ATRX，GINS家族可能通过调控免疫微环境影响胶质瘤患者预后，CD276和CX3CL1可能是S1亚型胶质瘤患者实施免疫治疗的潜在靶点，CHEMBL66033、266935、293914、436859、1594881可能是潜在的靶向GINS2的中药小分子。结论：基于GINS家族构建的胶质瘤分子分型有助于识别更适合免疫治疗的高风险患者，筛选出的中药小分子可为胶质瘤患者分子靶向治疗和免疫治疗提供参考。
Full text:20240308.pdf