Clinical significance of ferroptosis-related lncRNAs in prognosis and immune infiltration in clear cell renal cell carcinoma based on bioinformatics analysis
DOI：10.3872/j.issn.1007-385x.2023.03.008
- VernacularTitle:基于生物信息学分析铁死亡相关lncRNA对肾透明细胞癌组织免疫浸润和患者预后评估的意义
- Author:
HU Xing1a
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3
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HU Liang2
1
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2
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YU Ting3
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WANG Qian1b
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ZHANG Zhihong1a
1
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2
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3
Author Information
1. 1a. Department of General Practice, 1b. Department of Geriatrics, the Affiliated Hospital of Southwest Medical University, Luzhou 646000, Sichuan, China;
2. Department of Cardiovascular Surgery, Western War Zone General Hospital, Chengdu 61000, Sichuan, China;
3. Class of 2019, Department of Clinical Medicine, Southwest Medical University, Luzhou 646000, Sichuan, China
- Publication Type:Journal Article
- Keywords:
肾透明细胞癌；铁死亡；lncRNA；标志物；预后；免疫浸润
- From:
Chinese Journal of Cancer Biotherapy
2023;30(3):237-248
- CountryChina
- Language:Chinese
-
Abstract:
[摘 要] 目的：采用生物信息学方法探索与肾透明细胞癌(ccRCC)组织中铁死亡相关的lncRNA，并探讨其与免疫细胞浸润及患者预后的相关性，为ccRCC患者提供新的分子靶点。方法：从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载ccRCC的转录本数据和临床数据，利用单样本基因集富集分析(ssGSEA)及相关性分析获得与铁死亡相关的lncRNA；通过单因素和多因素回归分析构建与铁死亡相关的lncRNA特征图，分析其与预后的关系；利用R软件分析铁死亡相关lncRNA与肿瘤免疫细胞浸润和药物敏感性之间的关系。构建铁死亡相关RNA网络，并通过qPCR验证中国人ccRCC组织和癌旁组织（取自2019年12月至2021年03月间在西南医科大学附属医院手术切除8例标本）中关键lncRNA的表达。结果：Kaplan-Meier分析表明，铁死亡评分高的患者总OS率低于铁死亡评分低的患者。单因素和多因素回归分析确定11个ccRCC铁死亡相关lncRNA可评估患者预后，并构建ccRCC患者1、3、5年预后预测列线图。免疫细胞浸润分析表明，铁死亡相关lncRNA与ccRCC免疫细胞浸润密切相关，其中LINC01871、PRKAR1B-AS1和CYTOR是调节肿瘤免疫细胞浸润的关键lncRNA。化疗药物敏感性分析表明，高风险患者对甲氨蝶呤、紫杉醇、顺铂和多柔比星更为敏感。构建的包含3个lncRNA、15个miRNA和15个mRNA的RNA网络中，验证实验显示LINC01871、LINC00472和CYTOR在ccRCC组织中显著上调。结论：通过生物信息学方法获得11个与铁死亡相关的lncRNA，证明其与ccRCC组织免疫细胞浸润、化疗药物敏感性和患者预后相关，为探索ccRCC铁死亡相关lncRNA标志物提供重要参考。
