1.Expression and biological processes of CHI3L2 in brain glioma and its impact on patient prognosis
ZHOU Yusen1 ; JIA Peng2△ ; LIAN Yixiang3 ; FANG Yuting1 ; CHEN Ting4 ; FAN Tianyu1 ; PENG Gaoyang1 ; HU Lijun1 ; YIN Jiangliu1
Chinese Journal of Cancer Biotherapy 2024;31(10):997-1007
[摘 要] 目的：基于生物信息学方法探究几丁质酶-3样蛋白2（CHI3L2）在脑胶质瘤中的表达和生物学过程及其对患者临床预后的影响。方法：以中国脑胶质瘤基因组图谱（CGGA）为训练集（n = 325）、癌症基因组图谱（TCGA）为验证集（n = 702），对CHI3L2与脑胶质瘤患者临床病理特征的关系、预后价值和生物学过程进行交叉验证分析。用Kaplan-Meier法进行生存分析，采用Cox回归模型分析CHI3L2表达及相关临床病理特征与脑胶质瘤患者预后的关系，利用受试者工作特征（ROC）曲线分析CHI3L2在脑胶质瘤诊断中的价值，用GO、KEGG及GSVA途径分析CHI3L2在脑胶质瘤中的潜在生物学过程，构建CHI3L2的列线图以校准曲线及C-Index值来评估预测的准确性。WB法和qPCR 法检测CHI3L2在正常星形胶质细胞HA1800、胶质瘤U215和U87细胞中蛋白质与mRNA水平表达的影响。选取长沙市中心医院病理科保存的7例正常脑组织、5例低级别胶质瘤（LGG, WHOⅠ~Ⅱ级）和6例胶质母细胞瘤（GBM，WHO Ⅳ级）标本进行免疫组化染色分析，验证CHI3L2在正常脑组织和不同级别脑胶质瘤组织中的表达情况。结果：CHI3L2在GBM（P < 0.000 1）、非1p/19q编码（P < 0.000 1）、IDH-野生型（P < 0.000 1）、非MGMT甲基化（P<0.01）患者中显著表达，对GBM具有一定的预测价值，并且是脑胶质瘤患者总生存期（OS）的独立预后因素（P < 0.001）。构建的列线图对脑胶质瘤患者的生存预后预测性良好。CHI3L2与LGG和GBM的免疫细胞浸润水平、肿瘤免疫微环境和免疫细胞均有显著关系。脑胶质瘤中CHI3L2蛋白（P < 0.05）和mRNA（P < 0.000 1）的表达水平与更高的恶性程度相关，免疫组化的结果进一步验证了这个发现。结论：CHI3L2的表达与脑胶质瘤的恶性程度、临床病理特征及预后关系密切，并且参与脑胶质瘤的肿瘤微环境和免疫浸润，有望成为脑胶质瘤治疗策略中的一个新靶点。
Result Analysis
Print
Save
E-mail