1.Effects of uncoupling protein 2 on prognosis and immune microenvironment of skin cutaneous melanoma
YANG Peipei ; YANG Junhan ; LIU Mengting ; HUANG Xieping ; XU Ganglin
Chinese Journal of Cancer Biotherapy 2022;29(10):921-929
[摘 要] 目的:探讨解偶联蛋白2(UCP2)在皮肤黑色素瘤(SKCM)中的预后价值,分析UCP2表达与SKCM肿瘤浸润免疫细胞(TIC)之间的相关性。方法:通过GEPIA在线数据库分析SKCM组织及正常皮肤组织中UCP的差异性表达,探讨UCP表达与SKCM预后之间的关系。HPA数据库分析UCP2在正常皮肤单细胞中的表达情况,使用TISCH分析UCP2在SKCM中单细胞水平的表达情况。TIMER分析UCP2表达与总SKCM、原发性SKCM和转移性SKCM患者肿瘤微环境(TME)中主要免疫细胞及其标志物的相关性。结果:UCP2在SKCM癌组织中高表达,UCP2高表达患者的OS和DFS均长于低表达患者(均P<0.05)。正常皮肤和SKCM单细胞分析显示,UCP2表达与免疫细胞亚群存在一定的正相关,同时与SKCM中趋化因子、受体、组织相容性复合物、免疫抑制剂和免疫激活剂五类免疫途径密切相关(均P<0.05)。亚组分析结果显示,UCP2高表达与总SKCM和转移性SKCM患者高OS密切相关(均P<0.05)。UCP2表达与总SKCM、原发性SKCM、转移性SKCM患者TME中TIC之间存在明显的正相关(均P<0.05),但是与原发性SKCM相关性相对较弱。UCP2表达水平与3组SKCM患者TME中免疫细胞标志物存在明显的正相关(均P<0.05)。结论:UCP2在SKCM组织中高表达,UCP2与SKCM中TIC呈正相关,是TME中重要的调控因子,与其预后密切相关。
2.Analysis of the value of NFKBIA in prognosis and immune infiltration of SKCM based on multiple public databases
YANG Junhan ; XU Ganglin ; LIU Mengting ; HUANG Xieping ; YANG Peipei
Chinese Journal of Cancer Biotherapy 2023;30(1):55-61
[摘 要] 目的:探讨核因子κB抑制因子a(NFKBIA)表达与皮肤黑色素瘤(SKCM)患者预后及其与肿瘤微环境免疫浸润的相关性。方法:利用GEPIA2数据库分析正常皮肤和SKCM组织中NFKBIA的表达差异,GEPIA2和Ualcan数据库分析NFKBIA与SKCM预后关系,TIMER和TISIDB数据库分析NFKBIA与SKCM中TIL和免疫调节基因的关系。选用TISCH和CancerSEA数据库从单细胞水平分析NFKBIA与SKCM细胞亚群及其相关的功能状态关联性。选取湖北省荆门市第二人民医院保存的14例SKCM患者的石蜡组织标本,通过免疫组织化学染色法验证SKCM组织和癌旁组织中NFKBIA蛋白的表达水平。结果:NFKBIA在SKCM组织中呈低表达,并且低表达的SKCM患者预后差(P<0.05)。NFKBIA表达与B细胞、CD8+ T细胞、CD4+ T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞和DC浸润水平呈正相关关系(均P<0.01)。NFKBIA表达与SKCM中TIL丰度和免疫调节基因呈正相关关系(均P<0.01)。NFKBIA在SKCM单细胞免疫细胞中表达,且与肿瘤微环境中细胞分化和炎症呈正相关关系(R=0.28、0.23,均P<0.05)。免疫组织化学染色结果证实,NFKBIA蛋白在SKCM组织中阳性表达率显著低于癌旁组织(35.71% vs 85.71%,P<0.05)。结论:NFKBIA在SKCM组织中呈低表达,与SKCM免疫细胞浸润相关,可作为SKCM预后的标志物及治疗靶点。