1.Bioinformatics-based identification of a disintegrin and metalloprotease 8 as a potential shared target for inflammatory bowel disease and colorectal cancer
ZHANG Hong1 ; YANG Lanjie2△ ; ZHEN Yuanyuan1 ; HUANG Yihua1 ; XIANG Feng2 ; ZHANG Yongzhen1 ; HAN Junling1
Chinese Journal of Cancer Biotherapy 2025;32(6):611-619
[摘 要] 目的:筛选炎症性肠病(IBD)和结直肠癌(CRC)的潜在共病基因,探讨关键基因去整合素-金属蛋白酶8(ADAM8)与IBD及CRC发生发展的关系及其潜在机制。方法:基于从GEO数据库和TCGA数据库下载IBD及CRC患者的转录组数据及对应临床资料,通过差异分析、预后基因筛选及交集分析鉴定同致共病基因。用多个数据集分析和验证关键基因ADAM8在IBD及CRC中的表达特征及其与临床病理指标的关系。生存分析探究ADAM8在CRC中的预后价值。功能和通路富集分析探究ADAM8影响CRC进展的潜在机制,进一步用肿瘤微环境算法评估ADAM8与肿瘤微环境的关系。用免疫组化(IHC)法检测中国人CRC组织中的表达验证数据库数据。结果: ADAM8为IBD和CRC的潜在关键共病基因。ADAM8在IBD和CRC组织中均呈高表达(均P < 0.01),且其高表达提示疾病病理进展(P < 0.01)。高表达ADAM8的CRC患者总生存期(OS)更短(P < 0.05或P < 0.01)。ADAM8在中国人CRC组中也呈高表达(P < 0.01)。免疫细胞迁移、细胞因子产生及免疫受体相互作用等通路与ADAM8表达密切关联,ADAM8表达与中性粒细胞、巨噬细胞等免疫细胞浸润水平呈正相关(P < 0.01或P < 0.001)。结论:ADAM8在IBD和CRC组织中呈高表达,与患者预后、疾病进展及免疫细胞浸润密切关联,有望成为2种疾病的共同干预靶点。
2.Bioinformatic screening reveals the significance of MFAP2 in the prognosis and immunotherapy of gastric cancer
ZHANG Hong1 ; HUANG Yihua1 ; LE Xianghua1 ; LIU Bin2 ; WEI Pinqiu3 ; HAN Junling1 ; ZHANG Yongzhen1
Chinese Journal of Cancer Biotherapy 2024;31(7):707-714
[摘 要] 目的:筛选影响胃癌患者预后及治疗的关键基因,分析关键基因微纤维相关蛋白2(MFAP2)在提示胃癌患者预后及免疫治疗敏感性中的价值。方法:从TCGA数据库下载胃癌患者的癌和癌旁组织的表达谱数据及临床资料。综合加权基因共表达网络分析(WGCNA)和单因素Cox回归分析筛选与胃癌预后显著相关的基因。使用多个患者队列评估关键基因MFAP2的预后价值,分析其效能和临床病理指标的相关性。使用多个在线数据库数据及算法分析MFAP2与肿瘤免疫微环境的关联,免疫表型评分(IPS)联合免疫治疗患者队列分析MFAP2在预测免疫治疗响应性中的价值。采用多数据集验证MFAP2在胃癌及癌旁组织中的表达差异。结果:蓝色模块与胃癌患者的生存结局相关性最高(R=0.17,P<0.001);进一步与预后相关基因取交集,共筛选到20个关键基因。关键基因MFAP2的高表达提示胃癌的不良预后和病理进展(HR>1,P<0.05)。MFAP2与肿瘤相关成纤维细胞密切相关,高表达MFAP2的胃癌患者对免疫治疗更不敏感。多数据集验证结果显示,MFAP2 mRNA在胃癌组织中高表达(P<0.05或P<0.01)。结论:MFAP2的高表达是胃癌预后不良和免疫治疗响应不佳的提示因子,有望作为胃癌的新型治疗靶点和预后标志物。