Effect of high expression of GSDME in nasopharyngeal carcinoma tissues on immune infiltration of tumor microenvironment and patient prognosis
- VernacularTitle:鼻咽癌组织中高表达的GSDME对TME免疫浸润和患者预后的影响
- Author:
DING Yia
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LI Kunfanga△
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WANG Rana
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ZHANG Juanninga
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YUAN Poyuna
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BI Xinmana
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YU Jishuanga
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QU Yanlinb
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Author Information
- Publication Type:Journal Article
- Keywords: 鼻咽癌；细胞焦亡；GSDME；预后；免疫细胞浸润
- From: Chinese Journal of Cancer Biotherapy 2023;30(6):489-496
- CountryChina
- Language:Chinese
- Abstract: [摘 要] 目的：探究细胞焦亡相关基因GSDME在鼻咽癌组织中的表达及其对肿瘤微环境（TME）和患者预后的影响。方法：从TCGA数据库获得548例鼻咽癌患者的基因表达数据及临床资料，运用R语言对GSDME进行差异表达分析、GO-KEGG富集分析；从人类蛋白质图谱（HPA）数据库中获取GSDME蛋白在鼻咽癌组织和相应癌旁组织中的表达数据，通过STRING数据库探究与GSDME相互作用的蛋白质网络；应用ssGSEA算法分析GSDME在鼻咽癌组织中的表达及其与24种免疫细胞浸润的相关性，运用Spearman法分析GSDME与免疫检查点分子的相关性，通过TISIDB数据库分析GSDME表达与细胞因子基因表达的相关性。单因素和多因素COX回归分析筛选预后风险因素，基于风险因素GSDME绘制预后预测列线图和校准图，根据GSDME的表达水平对鼻咽癌患者进行生存分析和风险分析。qPCR法验证中国人鼻咽癌组织中GSDME及4种趋化因子mRNA的表达。结果：数据库数据分析显示，与癌旁组织相比，鼻咽癌组织中GSDME呈高表达（P<0.01），GO-KEGG富集分析显示GSDME参与免疫反应、细胞焦亡相关信号通路，GSDME表达与免疫细胞浸润、细胞因子及免疫检查点分子表达等相关，qPCR检查结果验证了中国人鼻咽癌组织中GSDME呈高表达。GSDME表达量、N分期和M分期是鼻咽癌患者预后的风险因素，基于风险因素建立的列线图和校正图能较好地预测鼻咽癌患者OS，鼻咽癌组织中GSDME高表达的患者预后差。结论：GSDME在鼻咽癌癌组织中呈高表达且是患者预后风险因素，基于GSDME建立的列线图预测预后效能良好；GSDME高表达与TME免疫浸润有关，其可能是免疫治疗的潜在靶点。
- Full text:20230605.pdf
