Clinical significance of ferroptosis-related lncRNAs in prognosis and immune infiltration in clear cell renal cell carcinoma based on bioinformatics analysis
DOI：10.3872/j.issn.1007-385x.2023.03.008
- VernacularTitle:基于生物信息学分析铁死亡相关lncRNA对肾透明细胞癌组织免疫浸润和患者预后评估的意义
- Author:
HU Xing1a
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HU Liang2
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YU Ting3
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WANG Qian1b
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ZHANG Zhihong1a
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Author Information
1. 1a. Department of General Practice, 1b. Department of Geriatrics, the Affiliated Hospital of Southwest Medical University, Luzhou 646000, Sichuan, China
2. 2. Department of Cardiovascular Surgery, Western War Zone General Hospital, Chengdu 61000, Sichuan, China
3. 3. Class of 2019, Department of Clinical Medicine, Southwest Medical University, Luzhou 646000, Sichuan, China
- Publication Type:Journal Article
- Keywords:
肾透明细胞癌；铁死亡；lncRNA；标志物；预后；免疫浸润
- From:
Chinese Journal of Cancer Biotherapy
2023;30(3):237-248
- CountryChina
- Language:Chinese
-
Abstract:
[摘 要] 目的：采用生物信息学方法探索与肾透明细胞癌(ccRCC)组织中铁死亡相关的lncRNA，并探讨其与免疫细胞浸润及患者预后的相关性，为ccRCC患者提供新的分子靶点。方法：从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载ccRCC的转录本数据和临床数据，利用单样本基因集富集分析(ssGSEA)及相关性分析获得与铁死亡相关的lncRNA；通过单因素和多因素回归分析构建与铁死亡相关的lncRNA特征图，分析其与预后的关系；利用R软件分析铁死亡相关lncRNA与肿瘤免疫细胞浸润和药物敏感性之间的关系。构建铁死亡相关RNA网络，并通过qPCR验证中国人ccRCC组织和癌旁组织（取自2019年12月至2021年03月间在西南医科大学附属医院手术切除8例标本）中关键lncRNA的表达。结果：Kaplan-Meier分析表明，铁死亡评分高的患者总OS率低于铁死亡评分低的患者。单因素和多因素回归分析确定11个ccRCC铁死亡相关lncRNA可评估患者预后，并构建ccRCC患者1、3、5年预后预测列线图。免疫细胞浸润分析表明，铁死亡相关lncRNA与ccRCC免疫细胞浸润密切相关，其中LINC01871、PRKAR1B-AS1和CYTOR是调节肿瘤免疫细胞浸润的关键lncRNA。化疗药物敏感性分析表明，高风险患者对甲氨蝶呤、紫杉醇、顺铂和多柔比星更为敏感。构建的包含3个lncRNA、15个miRNA和15个mRNA的RNA网络中，验证实验显示LINC01871、LINC00472和CYTOR在ccRCC组织中显著上调。结论：通过生物信息学方法获得11个与铁死亡相关的lncRNA，证明其与ccRCC组织免疫细胞浸润、化疗药物敏感性和患者预后相关，为探索ccRCC铁死亡相关lncRNA标志物提供重要参考。
