Analysis of the value of NFKBIA in prognosis and immune infiltration of SKCM based on multiple public databases
DOI:10.3872/j.issn.1007-385x.2023.01.008
- VernacularTitle:整合多数据库分析NFKBIA在SKCM预后和免疫浸润中的价值
- Author:
YANG Junhan
1
,
2
,
3
;
XU Ganglin
1
,
2
,
3
;
LIU Mengting
1
,
2
,
3
;
HUANG Xieping
1
,
2
,
3
;
YANG Peipei
1
,
2
,
3
Author Information
1. Department of Dermatology, Jingmen No.2 People&prime
2. s Hospital &
3. Affiliated Central Hospital of Jingchu University of Technology, Jingmen 448000, Hubei, China
- Publication Type:Journal Article
- Keywords:
皮肤黑色素瘤;核因子κB抑制因子α;肿瘤浸润淋巴细胞;预后
- From:
Chinese Journal of Cancer Biotherapy
2023;30(1):55-61
- CountryChina
- Language:Chinese
-
Abstract:
[摘 要] 目的:探讨核因子κB抑制因子a(NFKBIA)表达与皮肤黑色素瘤(SKCM)患者预后及其与肿瘤微环境免疫浸润的相关性。方法:利用GEPIA2数据库分析正常皮肤和SKCM组织中NFKBIA的表达差异,GEPIA2和Ualcan数据库分析NFKBIA与SKCM预后关系,TIMER和TISIDB数据库分析NFKBIA与SKCM中TIL和免疫调节基因的关系。选用TISCH和CancerSEA数据库从单细胞水平分析NFKBIA与SKCM细胞亚群及其相关的功能状态关联性。选取湖北省荆门市第二人民医院保存的14例SKCM患者的石蜡组织标本,通过免疫组织化学染色法验证SKCM组织和癌旁组织中NFKBIA蛋白的表达水平。结果:NFKBIA在SKCM组织中呈低表达,并且低表达的SKCM患者预后差(P<0.05)。NFKBIA表达与B细胞、CD8+ T细胞、CD4+ T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞和DC浸润水平呈正相关关系(均P<0.01)。NFKBIA表达与SKCM中TIL丰度和免疫调节基因呈正相关关系(均P<0.01)。NFKBIA在SKCM单细胞免疫细胞中表达,且与肿瘤微环境中细胞分化和炎症呈正相关关系(R=0.28、0.23,均P<0.05)。免疫组织化学染色结果证实,NFKBIA蛋白在SKCM组织中阳性表达率显著低于癌旁组织(35.71% vs 85.71%,P<0.05)。结论:NFKBIA在SKCM组织中呈低表达,与SKCM免疫细胞浸润相关,可作为SKCM预后的标志物及治疗靶点。
- Full text:20230108.pdf