Analysis of expression and clinical significance of METTL7B in glioma tissues based on bioinformatics
DOI:10.3872/j.issn.1007-385x.2022.01.009
- VernacularTitle:基于生物信息学分析METTL7B在胶质瘤组织中的表达及其临床意义
- Author:
ZHOU Jie
1
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XU Dan
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LI Bo
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WANG Shouchao
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LI Huan
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XU Haibo
Author Information
1. Department of Radiology, Zhongnan Hospital of Wuhan University, Wuhan 430071, Hubei, China
- Publication Type:Journal Article
- Keywords:
胶质瘤;甲基转移酶样蛋白7B;免疫浸润;生物标志物;预后
- From:
Chinese Journal of Cancer Biotherapy
2022;29(1):55-62
- CountryChina
- Language:Chinese
-
Abstract:
[摘 要] 目的:探讨甲基转移酶样蛋白7B(METTL7B)在胶质瘤组织中的表达及其与患者临床病理特征和预后的相关性。方法:基于CGGA数据库胶质瘤数据和GTEx数据库正常脑组织数据,分析METTL7B基因在胶质瘤与正常脑组织中的表达差异,并用GEPIA数据库数据和免疫组织化学染色法进行验证。用Kaplan-Meier生存分析、单因素Cox分析、多因素Cox分析及ROC曲线分析等评估METTL7B在胶质瘤患者预后中的价值,用CGGA数据库数据分析METTL7B表达与胶质瘤患者临床病理特征的相关性,用CIBERSORT及TIMER数据库进行肿瘤免疫细胞浸润分析,进行KEGG通路富集分析及GO功能富集分析,通过基因共表达分析确定与METTL7B相关的基因。结果:METTL7B在胶质瘤组织中明显上调(均P<0.05),METTL7B表达是胶质瘤患者独立的不良预后因素。METTL7B高表达与高龄(>41岁)、肿瘤分级增加、肿瘤复发或继发性肿瘤、IDH野生型、1p19q非共缺失以及肿瘤的恶性病理学有关联(均P<0.01);METTL7B表达与B细胞、CD4+ T细胞、CD8+ T细胞、单核细胞、中性粒细胞、巨噬细胞、活化肥大细胞等免疫细胞有关联(均P<0.05)。KEGG通路富集及GO功能分析结果显示,肿瘤相关信号通路及多种免疫反应在METTL7B高表达表型中显著富集。基因共表达分析结果表明,METTL7B与TNFRSF12A、CHI3L1、EMP3表达呈正相关(r=0.807、0.804、0.783,均P<0.01),与ELFN2、REPS2、SHANK2表达呈负相关(r=-0.642、-0.627、-0.602,均P<0.01)。结论:METTL7B在胶质瘤组织中的表达上调是预后不良的指标,且与肿瘤免疫浸润相关。
- Full text:20220109.pdf