Clinical significance of BRD-containing protein members in hepatocellular carcinoma progression
DOI: 10.3872/j.issn.1007-385x.2021.05.012
- VernacularTitle:BRD蛋白家族在肝细胞癌中的临床意义
- Author:
WANG Suyuan
1
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WANG Mu
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LI Yunhui
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LI Mengxuan
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HOU Jin
Author Information
1. Institute of Immunology, State Key Laboratory of Medical Immunology, Navy Military Medical University, Shanghai 200433, China
- Publication Type:Journal Article
- Keywords:
BRD；肝细胞癌；肿瘤进展；预后判断
- From:
Chinese Journal of Cancer Biotherapy
2021;28(5):504-510
- CountryChina
- Language:Chinese
-
Abstract:
目的：通过检索挖掘多个肿瘤公共数据库中肝细胞癌（hepatocellular carcinoma，HCC）的相关数据，从转录本、蛋白质、基因突变、蛋白相互作用及相应的信号通路和功能富集等不同层面，揭示BRD（bromodomain）蛋白家族与HCC的相关性，探索BRD蛋白家族作为HCC的肿瘤进展及预后判断的潜在生物标志物价值。方法：从UALCAN数据库中获取BRD蛋白家族所有成员在HCC患者组织样本中的mRNA表达数据和患者临床信息并进行相关性分析。从TCGA数据库中获取BRD蛋白家族mRNA表达水平与HCC患者预后的数据并进行相关性分析。从The Human Protein Atlas数据库中获取BRD蛋白家族在HCC组织和正常肝组织中的免疫组化结果并进行对比分析。使用STRING数据库获取BRD蛋白家族的相互作用蛋白网络，并利用CYTOSCAPE软件对获取的相互作用蛋白进行KEGG和GO分析。结果：BRD家族7个成员均在HCC组织中高表达（P<0.01），并且与HCC患者肿瘤分级和临床分期正相关（P<0.01）,同时BRD8和BRD9的低表达提示HCC患者预后较好（P<0.05）。BRD相互作用蛋白主要参与组蛋白乙酰化修饰，并高度富集于HCC相关的信号通路。TP53基因突变HCC患者的BRD1、BRD3、BRD4、BRD7、BRD8和BRD9表达水平显著高于非突变患者（P<0.05）。结论：BRD蛋白家族分子能够作为HCC患者肿瘤分级、临床分期和预后判断的潜在靶标。
- Full text:20210512.pdf
