Exploration of epithelial cell heterogeneity and immune characteristics of the tumor microenvironment in ovarian cancer based on single cell sequencing
DOI:10.3872/j.issn.1007-385x.2025.07.011
- VernacularTitle:基于单细胞测序探索卵巢癌上皮细胞异质性和肿瘤微环境免疫特征
- Author:
LI Rongji
1
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ZHAO Lizhu
1
;
YANG Lihua
1
Author Information
1. Department of Gynecology, the Second Affiliated Hospital of Kunming Medical University, Kunming 650101, Yunnan, China
- Publication Type:Journal Article
- Keywords:
卵巢癌;上皮细胞;肿瘤微环境;单细胞测序
- From:
Chinese Journal of Cancer Biotherapy
2025;32(7):754-760
- CountryChina
- Language:Chinese
-
Abstract:
[摘 要] 目的:基于公开的卵巢癌(OC)单细胞测序数据并利用生物信息学方法构建OC上皮细胞亚型,探究上皮细胞异质性及其对OC肿瘤微环境(TME)的影响。方法:使用GSE118828卵巢癌单细胞数据集的分析得到的8种细胞类型及基因表达矩阵结果,使用反卷积方法估计整体转录组测序(bulk RNA-seq)数据中的细胞组成,依据上皮细胞丰度将OC分为高上皮细胞亚型(C1型)和低上皮细胞亚型(C2型)。分析C1型与C2型患者的生存时间及免疫微环境差异。基于C1、C2型及OC早期(Ⅰ~Ⅱ期)、晚期(Ⅲ~Ⅳ期)组间的差异表达基因(DEG),筛选与OC进展相关的上皮细胞相关基因并分析其对TME的影响。通过人类蛋白质图谱(HPA)数据库数据验证OC进展中上皮细胞相关基因的蛋白表达水平。结果:C1型患者的OS明显优于C2型患者(P < 0.05)。C1、C2型具有完全不同的免疫微环境浸润特性,C1型中辅助性T(Th)细胞、M1型巨噬细胞和激活的树突状细胞浸润程度显著高于C2型(均P < 0.05)。晚期高上皮细胞OC患者HAS1、DAPL1、ADH1B基因表达增加(均P < 0.05),同时,DAPL1基因在OC中的表达与巨噬细胞、Treg细胞的浸润程度呈正相关(P < 0.05)。HPA数据库数据证实,DAPL1蛋白在OC组织中表达显著增加。结论:卵巢癌高上皮细胞亚型可能由于Th细胞、M1型巨噬细胞和激活的树突状细胞的高度浸润发挥抗肿瘤作用;上皮细胞相关基因DAPL1的高表达可能会诱导巨噬细胞、Treg细胞的浸润程度,从而促进OC的进展。
- Full text:202507300948120325620250711.pdf