Construction of a prognostic model with angiogenesis-related immune genes in ovarian cancer and analysis of tumor microenvironment
DOI：10.3872/j.issn.1007-385x.2024.08.008
- VernacularTitle:卵巢癌中血管生成相关免疫基因预后模型的构建和肿瘤微环境分析
- Author:
LYU Wei1
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WANG Jiali1
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LIU Tianxu1
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WANG Yu1
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LIU Lihua1,2,3
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3
Author Information
1. 1. Department of Tumor Immunotherapy, the Fourth Hospital of Hebei Medical University, Shijiazhuang 050000, Hebei, China
2. 2. Hebei Cancer Institute, Shijiazhuang 050000, Hebei, China
3. 3. International Cooperation Laboratory of Stem Cell Research, Hebei Medical University, Shijiazhuang 050000, Hebei, China
- Publication Type:Journal Article
- Keywords:
卵巢癌；血管生成；免疫治疗；预后；肿瘤微环境
- From:
Chinese Journal of Cancer Biotherapy
2024;31(8):803-814
- CountryChina
- Language:Chinese
-
Abstract:
[摘 要] 目的：采用生物信息学方法探索卵巢癌中与血管生成相关的免疫基因（ARIG），探讨其与卵巢癌患者预后的关系，并说明不同预后患者肿瘤微环境和免疫治疗的潜在差异，为卵巢癌患者提供新的治疗靶点。方法：分别从TCGA和GEO数据库下载卵巢癌的转录组数据和生存数据。利用R软件分析差异表达基因，利用Pearson相关系数鉴定血管生成相关基因与免疫相关基因之间的相关性，筛选出差异表达的ARIG。通过Lasso回归分析构建预后模型，通过Cox分析临床特征和风险评分，将样本分为高风险组和低风险组。通过单样本基因集富集分析（ssGSEA）、肿瘤免疫功能障碍和排斥（TIDE）分析预后风险模型与免疫浸润、免疫治疗反应的相关性。最后，收集河北医科大学第四医院2015年5月至2016年5月手术的卵巢癌患者的肿瘤组织和输卵管组织85对，通过qPCR和WB法验证五个差异表达的ARIG在卵巢癌组织中的表达情况，分析其与卵巢癌患者临床病理特征的关系，并初步探索其在卵巢癌细胞的生物学功能。结果：通过生信分析筛选出142个差异表达的ARIG，通过Lasso和Cox回归分析，得到5个基因作为预后基因（PTGER3、SCTR、IGHG1、HSPA8、IGF2），构建了预后风险模型，高风险组患者的预后更差；此外，不同风险评分的患者在免疫细胞浸润和免疫治疗反应方面存在显著差异（均P<0.05）。通过qPCR和WB法验证这5个基因在卵巢癌组织中均为高表达（均P<0.01），其中HSPA8表达量最高，且高表达HSPA8与卵巢癌患者FIGO分期晚、组织分级差、淋巴结转移及腹膜转移呈显著正相关（P<0.001）。细胞功能实验证实，HSPA8可促进卵巢癌细胞的增殖、迁移和侵袭（P<0.01）。结论：差异表达的5种ARIG能有效预测卵巢癌患者的预后，并且与免疫细胞浸润和免疫治疗疗效有关，初步证实其在卵巢中发挥促癌作用。
- Full text:202409040911356737220240808.pdf
