Single-cell sequencing reveals the inhibitory role of Ly6E on DC infiltration and function in the microenvironment of 4T1 breast cancer cell transplanted tumor

WU Yue1; Chen Yiting1; 2 Zhu Yanyang1; Lan Hailin1; 2 Zhou Linlin1; 2 Zhang Qiuyu1

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Single-cell sequencing reveals the inhibitory role of Ly6E on DC infiltration and function in the microenvironment of 4T1 breast cancer cell transplanted tumor

VernacularTitle:单细胞测序揭示Ly6E分子对乳腺癌4T1细胞移植瘤微环境中DC浸润及功能的抑制作用
Author: WU Yue1 ^{1
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2} ; CHEN Yiting1 ^{1
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2} ; ZHOU Linlin1,2 ^{1
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2} ; ZHANG Qiuyu1,2 ^{1
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Author Information

1. 1. Institute of Immunotherapy, Fujian Medical University, Fuzhou 305122, Fujian， China
2. 2. National Collaboration Center in Immuno-Oncology, Fuzhou 305122, Fujian, China
Publication Type:Journal Article
Keywords: 淋巴细胞抗原6复合物E；肿瘤免疫微环境；单细胞测序；树突状细胞；乳腺癌
From: Chinese Journal of Cancer Biotherapy 2024;31(8):759-768
CountryChina
Language:Chinese
Abstract: [摘要] 目的：本研究利用单细胞RNA测序分析技术（scRNA-seq）初步探索乳腺癌4T1细胞表达淋巴细胞抗原6复合物E（Ly6E）调控肿瘤免疫微环境（TIME）的潜在机制。方法：利用CRISPR-Cas9技术构建Ly6e基因敲除小鼠乳腺癌4T1细胞（Ly6E-KO），观察其和野生型细胞（Ly6E-WT）体外增殖和体内生长能力的差异。流式细胞术分选两类肿瘤组织中的CD45阳性细胞，再进行scRNA-seq分析。对于测序结果，首先利用Seurat软件包筛选差异表达基因谱，根据标记基因进行注释；再利用Cellchat和Monocle2软件分析细胞互作关系和特定免疫细胞的演化轨迹。结果：与Ly6E-WT相比，Ly6E-KO体外增殖能力无显著差异，但体内生长能力显著降低（P<0.001）。ScRNA-seq分析显示，Ly6E-KO移植瘤浸润DC比例显著高于Ly6E-WT，且DC处于更加活跃的增殖和分裂状态；三种DC亚群（pDC、cDC1和cDC3）与T细胞均存在显著的互作关系。同时发现，Ly6E-KO肿瘤中浸润T淋巴细胞增殖、活化及效应相关的基因表达水平均升高，提示Ly6E-KO具有更强抗肿瘤能力。最后，本研究对人类乳腺癌队列的scRNA-seq数据进行了分析，进一步证实了上述发现。结论：肿瘤细胞Ly6e基因敲除后可通过增加TIME中DC活化及浸润，继而增强机体抗肿瘤免疫应答。
Full text:202409040856243617420240803.pdf